El edificio por dentro estaba muy bien cuidado. Todo era gris, a excepción de la alfombra roja que se extendía a lo largo del edificio. Una plataforma cortaba la alfombra. Era como la que había visto en la Pradera Sagrada del Bosque, con el símbolo de la Trifuerza y un símbolo dorado encima de ésta. Había varios pilares a los lados y algunas ventanas por donde entraba la luz de la luna. Colgando del techo había candelabros con el símbolo de la Trifuerza. Al fondo había un pequeño altar y detrás de éste había una puerta con un símbolo extraño: era un círculo en medio del que salían varios rayos, y encima de la puerta estaba el símbolo de la Trifuerza. Link supo que ahí era la escena del trance con Zelda, de modo que no se había equivocado, ahí era el Templo del Tiempo.
Link caminó hasta el altar y Navi dijo:
—Aquí hay tres huecos y una inscripción... "Si posees tres piedras espirituales, toma la Ocarina del Tiempo y entona la Canción del Tiempo".
Como si hubiera sido orden lo que Navi dijo, Link tomó la Ocarina del Tiempo y tocó la Canción del Tiempo. Entonces la Esmeralda Kokiri, el Rubí Goron y el Zafiro Zora empezaron a flotar y se colocaron en los tres huecos del altar. Después, el símbolo de la Trifuerza encima de la puerta, de ser negro, pasó a ser dorado y la puerta, que Link supuso, era el Portal del Tiempo, se abrió, mostrando un pasillo y una habitación al fondo.