Tragedi kehilangan kapal perang Alien. Selepas Anton Slavik mengambil kembali tanah suci Brotherhood of Nod di Sarajevo, Kane memerintahkan Slavik dan kru Montauk untuk menyerahkan "kapal perang asing" kepadanya yang berisi Tacitus. Namun ketika pasukan Nod tiba di Bunker, kapal itu tidak ada di sana. Sama-sama ketika itu penghantaran Mesej dari Jeneral Vega ke Montauk. Vega telah berusaha menerbangkan kapal untuk "menyelesaikan skor lama di Amerika Selatan" tetapi, dia tidak dapat mengendalikannya, kapal itu telah hilang kawalan dan telah terjatuh di arah barat Texas, tepat di jalan pasukan GDI Michael McNeil yang sedang maju ke Mexico. Walaupun mereka dengan cepat mendirikan markas di sekitarnya (Sekitar Pesawat Alien) dan mulai mengambil artifak, pasukan Nod Jeneral Vega kemudiannya kehilangan kawalan di lokasi tersebut. Kemudian Jeneral Vega berusaha menghancurkan kapal perang asing dan menjauhkannya dari tangan GDI tetapi pasukan McNeil dapat menghentikannya. Kane sangat menginginkan pemulihan Tacitus dan percaya ia terletak di dalam kapal perang Alien tersebut. Tetapi kapal perang Alien kini terletak di tangan GDI; berada di dalam wilayah GDI. Prospek sekarang nampak suram bagi Anton Slavik, yang ditugaskan untuk memulihkan Tacitus.
Kebangkitan Brotherhood Of Nod di Amerika
Ketika pasukan GDI masuk ke Amerika Tengah dengan tujuan akhirnya menangkap pemimpin Nod Jeneral Vega ke 'keadilan' dan bersiap untuk menyerang pangkalan pulaunya dengan tergesa-gesa mereka meninggalkan banyak "beg" perlawanan Nod yang teratur di belakang mereka. Ketika GDI bergerak melawan Jeneral Vega, pasukan Jeneral Vega tiba-tiba berkurang dan mula mengganggu kawalan GDI ke atas banyak wilayah yang telah dibantu oleh Michael McNeil mereka. Dengan kekuatan GDI tiba-tiba terganggu, kini menjadi mungkin bagi Anton Slavik untuk terus meneruskan misinya. Namun Jeneral Vega nekad untuk memperoleh Tacitus untuk dirinya sendiri dan memperbaiki kedudukannya dengan Kane. Tetapi Anton Slavik telah diberi misi dan selain itu, Jeneral Vega berada di "kaki terakhirnya", pasukannya memberi maklumat tentang Tacitus tetapi GDI tidak ambil peduli.
Oleh itu, CABAL menasihatkan Anton Slavik untuk menjalankan misinya secara mandiri dengan bergantung kekuatan silap mata dan untuk pertimbangkan kekuatan Vega yang mungkin akan dia hadapi.
[Misi mencari kapal Alien]
Sangat mustahak bahawa Jeneral Vega tidak menguasai Tacitus tetapi sebahagian besar pasukan Nod yang ada di daerah itu setia kepada Vega dan oleh itu tidak mungkin bagi Anton Slavik untuk melancarkan serangan penuh terhadap pasukan GDI di daerah itu dan mendapatkan kembali kawalan tapak kemalangan (Crash Site Alien Warship) dengan cara itu. Sebagai gantinya, Slavik hanya perlu menghantar pasukan kecil untuk mengawal jurutera ke lokasi nahas dan menggunakan siluman untuk mengelakkan rondaan GDI. Pasukan itu dihantar ke pinggir Hobbs dan menggunakan sebuah kereta peluru melintas. Setelah menyingkirkan semua penjaga GDI di kota yang tidak mereka hindari, pasukan Slavik mengikuti jalan kereta api dan menerusi Prototaip Titans Mk.1 yang sedang berpatroli. Rondaan infantri lebih sukar untuk dihindari. Untuk mencari lokasi kemalangan, mereka mungkin telah menggunakan beberapa jurutera mereka untuk menguasai stesen Radar di utara, yang akan memberi mereka lokasi lokasi kemalangan dan juga kemungkinan mereka menggunakan kakitangannya sebagai pasukan ringan infantri. Mereka tergelincir melewati pangkalan zon pendaratan GDI dan memasuki kapal asing yang terhempas, menghilangkan semua rondaan yang telah menangkap mereka di sepanjang jalan. Sampai di sana ada seorang jurutera mengawal kapal itu, benarkan mereka memulakan pencarian Tacitus.
Bantuan Pasukan GDI telah tiba!
Askar Nod: Awhh Mehh serius la... Bantuan Pasukan GDI telah tiba!?.
Kapten Pasukan Nod: Kita mungkin ada sedikit masalah.... Bersedia!
Prototaip Titans Mk.1 (GDI): Bersedia untuk mati!!
Sementara itu di zon pendaratan GDI, MCV telah tiba. Semasa ketibaannya di sana, ia bergerak untuk mendirikan pangkalan di atas lokasi kemalangan, dengan harapan dapat menolak pasukan Nod masuk ke lokasi kemalangan. Sebaik sahaja pasukan Anton Slavik didapati mengendalikan kapal perang asing, kesemua Prototaip Titans yang mengawal pasukan MCV untuk mendirikan pangkalan mengarahkan senjata mereka ke kapal kemalangan, meletupkannya menjadi bangkai kapal yang tidak dapat diakses. Oleh itu kapal perang Alien diperjuangan GDI dan Nod untuk mengawalnya hingga ke akhir.
Askar Nod: Sedang mengambil Tacitus Tuan! Tacitus hilang. Anak buah Vega pasti sudah mengambil. [Mencari Didalam Kapal]
Jurutera itu masuk ke dalam kapal hanya untuk mengetahui bahawa Tacitus tidak ada. Pasukan itu juga menyedari bahawa Vega mungkin berusaha mengeluarkan Tacitus dari kawasan itu melalui kereta peluru ke utara. Sebenarnya GDI telah menghancurkan jambatan kereta api yang menuju ke luar kawasan untuk menghalangnya daripada melakukan itu dan sehingga setelah pasukan Anton Slavik memperbaiki jambatan itu, mustahil bagi Vega untuk memindahkan Tacitus ke luar kawasan. Pasukan Anton Slavik membunuh segelintir infanteri Jenderal Vega yang mereka temukan di sekitar kereta api dan mula menghancurkan kereta api. Mereka kemudian mula mencari di bangkai kapal untuk mengambil Tacitus.
Mereka tidak dapat menemui tanda-tanda Tacitus di dalam bangkai kereta api. Ketika salah seorang tentera Nod yang masih hidup dari pasukan mogok cuba melaporkan fakta tersebut kepada Anton Slavik yang marah dan mengancam, Pemimpin Forgotten Umagon yang cuba memukul dan membunuh lelaki itu ketika dia membuat laporannya. CABAL dapat menggunakan kemampuan pengkomputeran yang canggih untuk mencari identiti Umagon walaupun mereka tidak melihatnya dengan jelas. Puak The Forgotten telah menyerang pasukan Anton Slavik di daerah itu dan sekarang mustahil bagi mereka untuk berkolaborasi sama ada atau tidak kerana mereka telah benar-benar menghapuskan pasukan yang dikerahkan oleh Anton Slavik. Tacitus sebenarnya telah dikeluarkan dari kapal oleh Puak The Forgotten semasa Nod kembali ke Kuil Sarajevo yang lama dan ini berlaku sebelum Jeneral Vega pernah menerbangkannya kapal Alien ke Amerika Utara. Namun, Nod tidak mengetahui hal itu dan akibatnya mereka percaya bahawa Tacitus itu pasti berada di tangan The Forgotten Umagon. Anton Slavik menjadikannya Misi Utama untuk mengesan dan menangkap Umagon, mereka percaya mereka akan dapatkan balik The Tacitus
Jeneral Vega terbunuh setelah serangan GDI di pangkalannya ketika Kane melancarkan peluru berpandu nuklear, menghancurkan pulau di mana pangkalan itu berada, semua pasukan GDI dan tentunya Jeneral Vega sendiri. Mengakibatkan pasukannya di Amerika Utara jatuh langsung ke tangan Anton Slavik yang kini dapat menggunakannya untuk mengesan serangannya sendiri di GDI atau Puak The Forgotten dan menangkap Umagon. Tetapi kemenangan kemenangan Nod baru-baru ini tidak disedari dan Michael McNeil dengan berakhirnya kempen Amerika Tengah kini bebas untuk ditugaskan untuk mengalahkan Anton Slavik dan dijadikan Amerika Utara kembali di bawah kawalan GDI.
To Be Continued....
[Info tentang Puak The Forgotten]
The Forgotten adalah gabungan manusia yang menunjukkan mutasi genetik yang jarang berlaku yang membolehkan mereka bertahan dari Tiberium Toxemia, mereka menjadi bentuk kehidupan Tiberium yang pelik dan kacukan berasaskan karbon. Mereka dijauhi atau dibenci oleh majoriti manusia, dan sangat mengerikan dalam penampilan walaupun tidak selalu. The Forgotten biasanya disebut sebagai 'Shiners', kerana kemampuan bahagian kulit mereka yang berhenti menyerap radiasi racun Tiberium.