Lo primero que Elaya vio cuando se despertó fue oscuridad, mientras se acostumbraba a la oscuridad pensó en lo esta sucediendo, pensado en ello se dio cuenta que estaba en el útero de su madre una Ōtsutsuki, al entender decidió que debería descansar hasta su nacimiento y disfrutar sus últimos días de pereza ya que una vez que nazca no tendrá más tiempo libre.
Dao que los Ōtsutsuki estaban obsesionados con el poder decidió que cuando tenga edad suficiente entrenará para proteger a los que quiere empezando con kaguya, pensando en ella recordó su triste historia, nació para ser la matriarca del clan, viajo junto a isshiki Ōtsutsuki al mundo llamado tierra a plantar un árbol shinju o dios árbol, por razones que no se mencionan lo ataca dejándolo gravemente herido.
Kaguya cayó en el pequeño País de los Antepasados donde se encontraba el Dios Árbol. Kaguya fue llevada por unos hombres hacia Tenji, el emperador de ese país, a quien con un misterioso poder alteraría su memoria. Pronto, ella comenzaría a vivir en el país donde conocería a Aino quien fue designada a cuidar de ella y quien se convirtió en su amiga, con el tiempo, luego de un tiempo se enamoró del emperador tenji, convirtiéndose en concubina y quedando embarazada.
Cuando el país de Ese o Ka no kuni bajo la mentira de que un lago del País de los Antepasados realmente les pertenecía trataron de iniciar una guerra, Tenji trató siempre de mantener la paz, sin embargo uno de los ministros de Ese invadió el país queriendo tomar a Kaguya por su belleza, pero resultó en una masacre para los invasores.
Éste hecho les dio motivos suficientes al País de Ese para declarar una guerra a menos de que les dieran la cabeza de Kaguya, por lo que Tenji ordenaría a todo su ejército el perseguirla. Al enterarse de ésto, Kaguya junto con Aino deciden ir hacia el Dios Árbol, en donde fueron alcanzadas.
Para ganar más tiempo, Aino trata de razonar con Tenji, pero termina siendo asesinada para el horror de Kaguya. Por esta razón, Kaguya consumió el fruto del Dios Árbol adquiriendo la capacidad de manipular el Chakra, activando además el Tsukuyomi Infinito atrapando al mundo entero dentro del Genjutsu y uniéndolo al Dios Árbol, mientras atrapaba a Tenji quien desconocía que Kaguya estaba embarazada, ésta decide gobernar la tierra junto a sus hijos luego de que nacieran. Eventualmente, Kaguya dejaría libres a algunos humanos para no extinguirlos, borraría sus memorias y la empezaron a tratar como una diosa.
Meses después de esto, Kaguya dio a luz a sus dos hijos llamados Hagoromo y Hamura, ambos heredando su gran Chakra. Con el paso del tiempo Kaguya empezaría perder la confianza en la humanidad y el inmenso poder que poseía la empezaría a corromper, cosa que la llevó a la locura provocando que las personas empezaran a temerle y a tratarla como un demonio. En algún momento posterior, Kaguya infirió que miembros del clan llegarían al planeta para robar su Chakra. Para evitar ésto, Kaguya convirtió a las personas atrapadas en el Tsukuyomi Infinito en Zetsus Blancos, soldados ideales para ella, solo con la finalidad de combatir a los invasores si éstos llegaban al planeta. Kaguya dejó un pergamino con toda la información sobre dicha amenaza en un pergamino muy encriptado que dejó oculto en el palacio de su espacio Helado.
Debido a su locura, Kaguya quiso recuperar el chakra que tenían sus hijos, así que se fusionó con el Dios Árbol, dando nacimiento a un Diez Colas. La furiosa bestia arrasó con todas las tierras en busca de su chakra hasta que sus hijos, tras una intensa batalla, la derrotaron, procediendo a separar el poderoso Chakra de su madre, sellándola y sellando el Chakra en Hagoromo lo que lo convirtió en el primer Jinchūriki.
Estando sin poder, Kaguya se transformó en una estatua y los Zetsus Blancos que había creado fueron sellados dentro de ella, la estatua quedó dentro del cuerpo de roca y fue enviada al espacio. Esta sería conocida como la Luna, cuyo núcleo sería la estatua. Hamura posteriormente partiría con el resto del clan a la luna para proteger el cuerpo de su madre, mientras que Hagoromo se quedaría en la tierra, donde enseñó a la humanidad los conceptos del Chakra llegando a ser venerado y conocido como el Sabio de los Seis Caminos en un intento por hacer que las personas se conectasen entre sí utilizando el Chakra en vez de usarlo como un arma, tal y como Kaguya había hecho, ésto mediante un concepto conocido como Ninshū.
A pesar de esto, momentos antes de que sus hijos la pudieran sellar por completo, su voluntad se manifestó en su tercer hijo, Black Zetsu, quien empezó a hacer planes para revivir a su madre. Zetsu Negro posteriormente empezó con sus planes manipulando al mismo Indra, hijo mayor de Hagoromo y a sus descendientes, el Clan Uchiha y los descendientes de Asura, el hijo menor, el Clan Senju para que alguno de ellos despertara el Rinnegan, todo para que su madre reviviera.
Durante la Cuarta Guerra Mundial Shinobi, mientras Madara Uchiha luchaba con Naruto quien corto el tronco del Dios Árbol que estaba en el campo de batalla. En ese momento una voz le decía que absorbiera al Árbol Sagrado, cosa que el Uchiha hace sanando sus heridas y aumentando sus poderes. Posterior a esto, la presencia de Kaguya se manifiesta en el interior de Madara.
Finalmente revivida trata de recuperar el Chakra del mundo para finalmente ser sellada de nuevo.
Al pensar en esto decidió que la haría feliz ya que ella siempre sufrió a manos de sus seres queridos, traicionada por sus hijos y enfrentada por las reencarnaciones de sus nietos.
En cuanto a poder, no tenía mucho de que preocuparse ya que una vez que coma el fruto de Chakra podrá viajar a otro mundo y regresar.